使用场景

研究人员可以使用 BioEmu 快速生成蛋白质结构样本，用于研究蛋白质折叠过程。

药物设计人员可以利用该模型生成的蛋白质系综，探索潜在的药物结合位点。

教育工作者可以将 BioEmu 用于教学，帮助学生理解蛋白质动态结构的概念。

产品特色

通过深度学习生成蛋白质的结构样本

支持可扩展的蛋白质平衡系综模拟

提供高效的结构采样能力，适用于长序列蛋白质

支持与侧链重建和分子动力学松弛的集成

提供预训练模型权重，方便用户快速上手

支持通过 Hugging Face 下载模型参数，简化部署流程

提供详细的采样时间和性能数据，帮助用户优化使用

使用教程

1. 克隆 BioEmu 仓库并运行 setup.sh 脚本，创建包含所有依赖项的 Conda 环境。

2. 使用 sample.py 脚本，通过指定蛋白质序列和采样数量，生成结构样本。

3. 如果需要，可以通过 setup_sidechain_relax.sh 安装侧链重建和 MD 松弛工具。

4. 使用 bioemu.sidechain_relax 模块对生成的结构进行侧链重建和 MD 松弛。

5. 分析生成的结构样本，结合其他工具进行进一步的研究或应用。